自上世紀80年代以來，農業(yè)部水產品安全檢測與評價重點實驗室在國內較早系統(tǒng)開展水產品質量與安全方面的研究。實驗室圍繞我國現(xiàn)代漁業(yè)科技發(fā)展的重大戰(zhàn)略需求，瞄準水產品質量安全研究領域的國際前沿，針對行業(yè)發(fā)展過程中影響水產品質量安全的關鍵和共性技術難題，在基礎與應用基礎、關鍵與共性技術以及行業(yè)支撐三個層次上開展研究工作，著力實現(xiàn)我國水產品質量安全水平穩(wěn)步提升，逐步將實驗室建成為我國水產品質量安全研究和技術創(chuàng)新基地、人才培養(yǎng)基地、學術交流與技術合作中心。實驗室2011年依托農業(yè)部農產品質量安全學科群（綜合性實驗室）組建，為學科群內唯一從事水產品質量與安全研究的專業(yè)性實驗室，2016年順利通過農業(yè)部科教司組織的評審工作。

實驗室現(xiàn)有固定科研人員32人，研究生導師15人，基本涵蓋水產品質量安全研究所需專業(yè)領域，先后有4人次入選水科院質量安全學科委員會，1人擔任學科主任和領域首席科學家。現(xiàn)有國家農產品風險評估委員會委員1人、農業(yè)部農產品質量安全專家委員會成員3人；中國水科院百名英才培育計劃4人。重點實驗室擁有3500平方米的實驗室，以及500平方米的水生生物實驗室。實驗室建立了完善的儀器設備管理制度，擁有超高效液相色譜儀/四極桿/軌道阱高分辨串聯(lián)質譜儀、高效液相色譜等離子體串聯(lián)質譜儀、氣相色譜/質譜/質譜串聯(lián)聯(lián)用儀、液相色譜/質譜/質譜串聯(lián)聯(lián)用儀、氣相色譜/質譜聯(lián)用儀、全自動細菌鑒定、免疫分析系統(tǒng)等大中型精密儀器50余臺件。

近五年來，實驗室共承擔各類科研項目156項，合同經費5368萬元。作為項目依托單位和負責人，主持國家科技支撐計劃（課題）11項、國家科技基礎性工作專項2項、863項目1項、國家自然科學基金14項、國際合作項目2項。共發(fā)表學術論文299篇，其中SCI 42篇，EI 8篇，中文核心249篇；參編或主編著作11部；獲發(fā)明專利63項，實用新型專利5項；制定國家標準7項，行業(yè)標準23項。共獲各類獎項10項。其中，以主持單位獲省部級一等獎2項，二等獎1項，三等獎2項；以參加單位獲省部級一等獎2項，三等獎4項。

實驗室秉承“開放、流動、聯(lián)合、競爭”的運行機制，設置開放課題，組織學科群、實驗室內外學術交流，營造良好的學術氛圍。鼓勵年輕人潛心鉆研、自主創(chuàng)新，優(yōu)化人才、科研經費等科技資源配置，為科研人員創(chuàng)造優(yōu)越和寬松的科研環(huán)境。